“十三五”期間，內蒙古自治區蒙醫藥中醫藥事業發展保障有力，在完善服務體系、提升服務能力、創新科技發展模式、拓展對外交流等方面快速發展，蒙醫藥中醫藥的社會認知度不斷提升，社會效益不斷顯現，不斷向“人人基本享有蒙醫藥中醫藥服務”目標邁進。
“十三五”以來，內蒙古自治區以區級蒙醫醫院為龍頭，盟市級為骨干，旗縣級為基礎，基層醫療衛生機構蒙醫藥服務為網底，其他各類醫療機構蒙醫藥服務為補充的醫療服務體系逐步完善。80%的公立蒙醫中醫醫院達二級甲等以上，所有的三級蒙醫中醫醫院設立了“治未病”中心，二級蒙醫中醫醫院設立了“治未病科”。96.36%的社區衛生服務中心和91.31%的蘇木鄉鎮衛生院設蒙醫科或中醫科，82.24%的社區衛生服務站和64.68%的嘎查村衛生室能夠提供蒙醫藥或中醫藥服務。
在深化醫藥衛生體制改革方面，自治區推進公立蒙醫中醫醫院改革，保留蒙藥院內制劑和中藥飲片加成，落實387項蒙醫醫療服務和315項中醫醫療服務價格。開展蒙醫中醫醫院績效評價，推進臨床路徑管理，制定 158個蒙醫優勢病種診療方案和130個病種的蒙醫臨床路徑，形成完全應用蒙醫藥診治疾病考核方案。推進蒙醫中醫醫療聯合體建設，組建了蒙醫皮膚、蒙醫骨傷、心身醫學等專科聯盟。將蒙醫非藥物療法和蒙藥(包括成藥、制劑、飲片)納入醫保和新農合報銷目錄。
為不斷壯大蒙醫藥中醫藥人才隊伍，自治區在開展全國傳承工作室和流派工作室建設項目的基礎上，新建第六批全國學術經驗繼承20個、基層專家傳承工作室19個。自治區蒙醫中醫學術經驗繼承工作培養繼承人460名。同時，開展基層衛生技術人員蒙醫藥中醫藥知識與技能培訓。
“十三五”期間，內蒙古自治區蒙中醫藥管理局會同科技廳制定《十三五蒙醫藥科技創新專項規劃》，加強蒙醫藥中醫藥學科繼續創新。在新一輪領先學科、重點學科評審工作中，72個蒙醫中醫學科通過評審，數量達到上一輪的8倍。國家中藥標準化項目進展順利。完成新版蒙醫醫院門診病歷、住院病歷制定，16個病種的蒙醫臨床診療指南制定取得成果。完成國家級“民族醫藥文獻整理”項目，20項蒙醫藥適宜技術推廣項目通過國家驗收。
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